“水文、工程和环境地质勘查”是我院的重要工作之一，从事国家项目的矿山地质勘查及矿山水文地质、工程地质、环境地质勘查工作，还承担市场上多种水、工环及相关专业的矿山开采司法鉴定工作。
近年我院在开展水文地质调查、水文地质钻探、水文地质试验、水源勘探和工程地质等方面有突破性进展。化验室开展了岩土工程试验，满足了大型露天煤矿地质报告和煤矿设计的需要。引用液态二氧化碳洗井，采用多含水层混合井流理论，以流量井法提高抽水试验效率，电法确定暗河、隐伏岩溶分布，扩散法测井确定含水层深度、厚度。根据水文地质模型和计算参数要求，灵活选稳定流抽水试验和非稳定流抽水试验。应用综合勘查手段，提高矿山工程地质评价水平。开展城市建筑工程地质、灾害地质评定取得明显成效。通过物探和其他测试手段，加强了煤矿山有害气体、有害元素测试和评价，环境地质调查，极大的提高了一开采技术条件的研究水平。
自我院成立以来，主要承担了云南省煤矿勘查——威信县观音山详查项目、会泽县磷矿勘查项目，同时完成了市场上几十个小煤矿勘查的项目，这些勘查项目在省评审中心多次受奖励，优秀率达到90%以上。在社会地质中的房屋建设岩土勘察方面，承担过上百幢房屋的勘察工作，工程质量为优良：同时承担过高速公路勘查、中小型水电站勘查，在这些勘查项目中始终处于同行业领先水平。灾害地质领域里，完成了云南省大量煤矿山地质灾害危险性评估工作，报告通过率100%，其中多个报告获省国土厅优秀报告，除此之外，也大量做过水电站、房屋及工厂建设用地质灾害评估、环境评价等工作。
目前，多名技术骨干取得云南省司法厅颁发的矿山工程司法鉴定资格证书，现已完成了省内多个煤矿的司法鉴定工作，得到社会各界一致好评。
